专项审计的类型很多，在准则中并无明确的规定，多为根据报告的用途而决定了要做什么样的审计。如，股东之间拟股权转让，委托会计师事务所核实企业的净资产，为股权转让定价提供参考依据；单位拟申请财政专项资金补贴，委托会计师事务所对已投入资金的使用情况进行审计，作为向政府申请补贴的依据；国有单位的负责人调离岗位，上级部门委托会计师事务所对其任职期间的经济效益情况、资产管理情况、执行制度情况等进行审计，等等。因为审计目的不同，所执行的程序也不同，需要执业人员根据审计目的，识别承接项目主要存在的风险点，恰当地制定审计程序，才能有效地规避审计风险。

和年报审计不同，专项审计并无标准的工作底稿模板予以参考，对部分经验不足的执业人员来说，在审计过程中往往会产生无从下手的感觉。如果不能有效地识别审计风险，容易出现的问题是工作底稿模板化，审计程序固定化。

如：受委托方委托，对房地产企业的存货进行专项审计，却套用通用的生产型企业的存货模板，虽然底稿已经填满，却连单位有几个地块、哪些已开发哪些待开发、项目开工情况、完工程度、建设面积等基本情况一无所知。

对拟股权转让的净资产进行审计，对大量长期挂账的往来不作关注，发函未能收到回函时，仅执行常规的替代测试程序，未能对可收回性进行关注。此外，对负数余额直接执行重分类调整，却未核实究竟是属于长期挂账，还是以前年度账务处理错误。程序不到位，必定会导致虚挂资产与负债，不能合理地反映企业的净资产状况。